L'enseignement aborde les divers domaines de la génomique descriptive (séquences proprement dites et leur annotation), fonctionnelle (qui exploite les données de la génomique descriptive pour inventorier l'ensemble des ARN ou des protéines) et comparative (qui s'intéresse aux similarités et aux différences qui s'observent entre espèces différentes) par le biais d'un cours complété par de séances de TP et de TD. Sont ainsi traîtés :

• les stratégies expérimentales de séquençage et d'annotation
• les méthodes d'étude du transcriptome, du protéome et du métabolome dans le contexte de la génomique des bactéries
• la génomique pour étudier les processus evolutifs chez les bactéries
• quelques applications biotechnologiques ou médicales
• l’évolution récente des approches dans le domaine de la génomique environnementale
• les analyses statistiques associées à ces approches

L’étudiant devra être capable de :
- maitriser les divers concepts liés au développement de la génomique ainsi que les méthodes employées de manière à comprendre leur champ d’application et leurs limites.
- développer une analyse critique des concepts théoriques et des données expérimentales présentées dans la littérature scientifique.