Ce cours offre une opportunité unique pour les étudiants d’interagir avec des experts scientifiques internationaux de domaines très divers s’intéressant aux processus biologiques, biochimiques, biophysiques, génétiques, épigénétiques, mathématiques… impliqués dans la mise en place de la forme et de la structure d’un organe, d’une région, voire d’un organisme et qui lorsqu’ils dysfonctionnent peuvent être à l’origine d’anomalies dysmorphologiques rencontrées en particulier chez l’homme dans les maladies rares. Ces interactions se feront au décours d’un enseignement magistral, par l’analyse de publications scientifiques choisies et de discussions autour de ces travaux selon une formule journal club dans un contexte de bilinguisme anglais/français.
 

A l’issue de ce cours l’étudiant est capable de :
- Comprendre les phénomènes et enjeux de la morphogenèse en général et en particulier du massif crânio-facial et des dents
- Avoir acquis les connaissances de base en biologie, biochimie, biophysique, génétique, épigénétique, mathématiques…permettant de comprendre les processus décrits dans différents modèles
- Connaître les méthodes d’investigation et d’étude des phénomènes impliqués
- Suivre un enseignement en anglais
- Savoir analyser un article scientifique relatif aux thèmes d’étude (journal club)
- Les éléments du module peuvent être enseignés en français ou en anglais
- Pouvoir rédiger un document format « publication » sur un aspect choisi du programme

Gene bivalency at Polycomb domains regulates cranial neural crest positional identity.
Minoux M, Holwerda S, Vitobello A, Kitazawa T, Kohler H, Stadler MB, Rijli FM.
Science. 2017 Mar 31;355(6332). pii: eaal2913. doi: 10.1126/science.aal2913.


Molecular mechanisms of cranial neural crest cell migration and patterning in craniofacial development.
Minoux M, Rijli FM. Development. 2010 Aug;137(16):2605-21.

Fine tuning of craniofacial morphology by distant-acting enhancers.
Attanasio C, Nord AS, Zhu Y, Blow MJ, Li Z, Liberton DK, Morrison H, Plajzer-Frick I, Holt A, Hosseini R, Phouanenavong S, Akiyama JA, Shoukry M, Afzal V, Rubin EM, FitzPatrick DR, Ren B, Hallgrímsson B, Pennacchio LA, Visel A. Science. 2013 Oct 25;342(6157):1241006.


Hemodynamics driven cardiac valve morphogenesis.
Steed E, Boselli F, Vermot J. Biochim Biophys Acta. 2016 Jul;1863(7 Pt B):1760-6. doi: 10.1016

klf2a couples mechanotransduction and zebrafish valve morphogenesis through fibronectin synthesis.
Steed E, Faggianelli N, Roth S, Ramspacher C, Concordet JP, Vermot J. Nat Commun. 2016 May 25;7:11646.

Oscillatory Flow Modulates Mechanosensitive klf2a Expression through trpv4 and trpp2 during Heart Valve Development.
Heckel E, Boselli F, Roth S, Krudewig A, Belting HG, Charvin G, Vermot J. Curr Biol. 2015 May 18;25(10):1354-61.



A targeted next-generation sequencing assay for the molecular diagnosis of genetic disorders with orodental involvement.
Prasad MK, Geoffroy V, Vicaire S, Jost B, Dumas M, Le Gras S, Switala M, Gasse B, Laugel-Haushalter V, Paschaki M, Leheup B, Droz D, Dalstein A, Loing A, Grollemund B, Muller-Bolla M, Lopez-Cazaux S, Minoux M, Jung S, Obry F, Vogt V, Davideau JL, Davit-Beal T, Kaiser AS, Moog U, Richard B, Morrier JJ, Duprez JP, Odent S, Bailleul-Forestier I, Rousset MM, Merametdijan L, Toutain A, Joseph C, Giuliano F, Dahlet JC, Courval A, El Alloussi M, Laouin a S, Soskin S, Guffon N, Dieux A, Doray B, Feierabend S, Ginglinger E, Fournier B, de la Dure Molla M, Alembik Y, Tardieu C, Clauss F, Berdal A, Stoetzel C, Manière MC, Dollfus H, Bloch-Zupan A. J Med Genet. 2016 Feb;53(2):98-110.


Mapping cis-regulatory domains in the human genome using multi-species conservation of synteny.
Ahituv N, Prabhakar S, Poulin F, Rubin EM, Couronne O. Hum Mol Genet. 2005 Oct 15;14(20):3057-63.

In vivo enhancer analysis of human conserved non-coding sequences.
Pennacchio LA, Ahituv N, Moses AM, Prabhakar S, Nobrega MA, Shoukry M, Minovitsky S, Dubchak I, Holt A, Lewis KD, Plajzer-Frick I, Akiyama J, De Val S, Afzal V, Black BL, Couronne O, Eisen MB, Visel A, Rubin EM. Nature. 2006 Nov 23;444(7118):499-502.


Nanodentistry: combining nanostructured materials and stem cells for dental tissue regeneration.
Nanomedicine (Lond). 2012 Nov;7(11):1743-53. doi: 10.2217/nnm.12.146.
Mitsiadis TA1, Woloszyk A, Jiménez-Rojo L. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23210714

Genetic basis for tooth malformations: from mice to men and back again.
Clin Genet. 2011 Oct;80(4):319-29. doi: 10.1111/j.1399-0004.2011.01762.x. Epub 2011 Aug 23.
Mitsiadis TA1, Luder HU. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21819395

BMPs and FGFs target Notch signalling via jagged 2 to regulate tooth morphogenesis and cytodifferentiation.
Mitsiadis TA1, Graf D, Luder H, Gridley T, Bluteau G. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20685737
Development. 2010 Sep;137(18):3025-35. doi: 10.1242/dev.049528. Epub 2010 Aug 4.

Microfluidics co-culture systems for studying tooth innervation.
Pagella P1, Neto E2, Jiménez-Rojo L1, Lamghari M3, Mitsiadis TA1.
Front Physiol. 2014 Aug 25;5:326. doi: 10.3389/fphys.2014.00326. eCollection 2014.

Microfluidics co-culture systems for studying tooth innervation

Forces in ti ssue morphogenesis and patterning.
Heisenberg CP, Bellaïche Y.
Cell. 2013 May 23;153(5):948-62.

Mechanics of epithelial tissue homeostasis and morphogenesis.
Guillot C, Lecuit T.
Science. 2013 Jun 7;340(6137):1185-9.

Interplay of cell dynamics and epithelial tension during morphogenesis of the Drosophila pupal wing.
Etournay R, Popovic M, Merkel M, Nandi A, Blasse C, Aigouy B, Brandl H, Myers G, Salbreux G, Jülicher F, Eaton S. Elife. 2015 Jun 23;4:e07090. doi: 10.7554/eLife.07090.
WNT-SHH Antagonism Specifies and Expands Stem Cells prior to Niche Formation. Fuchs E. Cell. 2016
High-throughput discovery of novel developmental phenotypes. Nature 2016
Glucose Uptake and Runx2 Synergize to Orchestrate Osteoblast Differentiation and Bone Formation, Karsenty G. Cell. 2015
Zebrafish models of idiopathic scoliosis link cerebrospinal fluid flow defects to spine curvature. Science. 2016
A mechanism for the segregation of age in mammalian neural stem cells. Science. 2015